Berawal pada tahun 2002 tepatnya bulan Agustus diprakarsai oleh Dr. Kurniawan, S.T, M.Si, MM sebagai pendiri mendirikan warnet dan kursus komputer yang di beri nama Nusa Putra yang sering di singkat NSP di Jl. PGRI No.07 Cikole Kota Sukabumi. Pada saat itu melayani penggunaan sewa internet (NSP.Net) yang masih langka pada zaman itu dan kursus singkat komputer yang diberi nama Lembaga Latihan Nusa Putra (L2NSP) sebagai cikal bakal Universitas Nusa Putra yang kini dikenal.
Pada tahun 2004 berpindah ke Jl. Raya Cisaat No.76 kecamatan Cisaat Kabupaten Sukabumi. Pada tahun itu juga dengan sah berdirilah Yayasan Nusa Putra berdasarkan akta Notaris Nomor: 16 tanggal 15 Maret tahun 2004 dengan notaris Marah Hasyir, S.H, Sukabumi dan disahkan dengan nomor registrasi Nomor:38/Yas/2004/PN.CBD Pengadilan Negeri Cibadak kabupaten Sukabumi.
Setelah resmi berdiri Yayasan Nusa Putra mendirikan Lembaga Pendidikan Nusa Putra (LPI-NSP) mengawali pendidikan Profesional 1 tahun. Karena adanya regulasi Yayasan berdasarkan undang-undang Tahun 2006 susunan pengurus dan nama yayasan berubah berdasarkan akta perubahan menjadi Yayasan Perguruan Nusa Putra Sukabumi dengan Notaris Rose Takarina, SH, Jakarta Nomor: 57 tahun 2006. Lalu pada tahun 2006 berdirilah Sekolah Tinggi Teknologi Nusa Putra (STT-NSP) melalui SK Mendiknas Nomor 213/D/O/2007 maka STT Nusa Putra diakui sebagai pendidikan tinggi di bawah naungan Yayasan Perguruan Nusa Putra Sukabumi. Seiring dengan perkembangan dan jumlah mahasiswa yang meningkat, pada tahun 2012 lokasi kampus berpindah ke lokasi kampus yang sekarang ditempati sebagai kampus Universitas Nusa Putra. Pada saat ini Universitas Nusa Putra memiliki 10 Program Studi Sarjana (S1) dan 2 Program Studi program Diploma Tiga (D3) serta 1 Program Magister. Pada saat ini jumlah mahasiswa yang belajar di Universitas Nusa Putra telah mencapai 2715 dan telah memiliki alumni yang tersebar di seluruh Indonesia dan berbagai Negara. Universitas Nusa Putra berdiri berdasarkan Keputusan Menteri Riset, Teknologi dan Pendidikan Tinggi Nomor : 108/KPT/I/2018 Tentang Perubahan Bentuk Sekolah Tinggi Teknologi Nusa Putra di Sukabumi yang dikelola oleh Yayasan Perguruan Nusa Putra Sukabumi menjadi Universitas Nusa Putra di Sukabumi yang diselenggarakan oleh Yayasan Perguruan Nusa Putra Sukabumi. Tepatnya pada hari Jumat tanggal 02 Februari 2018, sejak hari itulah secara resmi Universitas Nusa Putra yang sering di singkat NPU (Nusa Putra University) secara resmi berdiri dengan menaungi 12 prodi, diantaranya adalah: Manajemen (S1), Teknik Informatika (S1), Ilmu Hukum (S1), Pendidikan Guru Sekolah Dasar (S1), Teknik Mesin (S1), Teknik Elektro (S1), Teknik Sipil (S1), Teknik Informatika (S1), Sistem Informasi (S1), Desain Komunikasi (S1), Teknik Mesin (D3), dan Teknik Elektronika (D3).
Berangkat dari menjadi Universitas Nusa Putra, maka program studi Magister Informatika yang merupakan program magister/pascasarjana pertama dan satu-satunya yang dimiliki oleh Universitas Nusa Putra. Program studi Magister Informatika Universitas Nusa Putra didirikan pada 3 Oktober 2019 berdasarkan SK Menteri Riset, Teknologi, dan Pendidikan Tinggi Republik Indonesia No. 922/KPT/I/2019. Berdasarkan SK tersebut, program studi ini dinyatakan telah memenuhi persyaratan minimum akreditasi. Prodi Magister Informatika menawarkan dua konsentrasi yang bisa dipilih oleh mahasiswa, yaitu artificial intelligence dan cyber security. Adapun jumlah mahasiswa yang terdaftar di Prodi Magister Informatika hingga saat ini adalah 45 orang (20 mahasiswa angkatan 2019 dan 25 mahasiswa angkatan 2020). Dari jumlah tersebut, 11 orang di antaranya adalah mahasiswa dengan kewarganegaraan asing yang berasal dari berbagai daerah seperti Afghanistan, Aljazair, Kamerun, Madagaskar, dan Pakistan.
Menjadi Program Studi Magister Informatika yang Unggul dibidang Artificial Intelligence dan Cyber Security di Tingkat Nasional pada Tahun 2025 dan Tingkat Dunia pada Tahun 2040.
Menyelenggarakan pendidikan, pembelajaran, dan pengajaran di bidang artificial intelligence dan cyber security yang berkualitas sesuai dengan standar pendidikan nasional dan internasional sehingga mampu menghasilkan sumber daya manusia (lulusan) yang berakhlak mulia, mandiri, dan profesional.
Mendorong dan menyediakan fasilitas bagi civitas akademika untuk melaksanakan inovasi, penelitian, dan publikasi di bidang informatika yang berkualitas dan bermutu tinggi sehingga dapat menghasilkan kontribusi keilmuan yang bermanfaat bagi masyarakat, baik secara langsung maupun tidak langsung.
Aktif melaksanakan program pengabdian dan pelayanan kepada masyarakat yang berbasis keilmuan informatika sebagai bentuk implementasi dari inovasi dan penelitian yang dilaksanakan oleh civitas akademika guna menjawab masalah dan tantangan masyarakat.
Mewujudkan tata kelola program studi yang baik dan akuntabel sehingga terbentuk sistem pendidikan yang berkualitas dan bermutu tinggi.
Menjalin kerjasama dengan berbagai institusi pemerintah maupun swasta yang memberikan dampak positif bagi kemajuan program studi, institusi, dan masyarakat.